A manga (mangifera indica l.) e um dos frutos mais consumidos no mundo nela podemos encontrar a mangiferina, uma xantona, presente nas folhas e caule, que possui diversas atividade biológicas como atividade antimicrobiana, imunomodulatora, antidiabética, anti-inflamatória , antioxidante, antineoplásica, e ações gastroprotetora, antineuraminidase, nefroprotetora, analgésica ,antiosteopose, antidiarreica anti-herpes , anti-HIV, anti-helmíntica e antialérgica. Atualmente as técnicas de simulação computacional, vem fomentando o estudo de macromoléculas no estudo e planejamento racional de fármacos as técnicas computacionais, entre essas técnicas está a dinâmica molecular, que e baseada nos princípios de mecânica molecular, onde podemos utilizar o princípio de campo de força para otimizar conformacionalmente a molécula. Nesse contexto o presente trabalho teve como objetivo, utilizar o campo de força Merck Molecular Force Field 94 (MMFF94) para caracterizar estruturalmente a mangiferina, sendo este uma etapa inicial de estudos de dinâmica molecular. Para obter a molécula com certeza de suas configurações atômicas foi utilizado o repositório virtual PubChew®,para desenho bidimensional da estrutura foi utilizado o software ACD/ChemSketch. Para otimização estrutural, seguindo o princípio de minimização de energia foi utilizado o software freeware Avogrado®, configurado para realizar cálculos de campo de força clássico Merck Molecular Force Field 94 MMFF94, com 500 ciclos de optimização steepest descent, com convergência 10e-7. Foram calculadas as propriedades da molécula Mangiferina(1,3,6,7tetrahydroxy-2-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]xanthen-9-one), onde foi possível caracterizar sua estrutura conformacional termodinamicamente mais estável com energia potencial no valor de 576,721 kJ mol-1 e momento dipolar igual a 1,512 D, sendo esta formada por ligações predominantemente covalentes (0,975436 Å à 1,53069 Å), em uma estrutura não linear, onde se destaca um angulo de 107,4º formado entre os átomos de O1, C14 e C17, e um de 112,6º entre o C12, C14 e C17,sendo possível identificar a possibilidade de formação de ligação de Hidrogênio intermolecular entre o H43 e o O9 (0,173 nm). Com os dados obtidos foi possível a visualizar tridimensionalmente a molécula e ainda plotar a superfície de Van de Waals (0,18 Å) e a superfície de acessibilidade a solvente. Sendo o presente trabalho uma etapa inicial para estudos de dinâmica molecular, docking molecular e Drug Design.